脊索動物ワカレオタマボヤ (Oikopleura dioica) の体の単純さを活用して、 (1) 内胚葉と外胚葉の上皮がつながり3D形態をもつ「くち」ができるしくみ、(2) 2Dシートである表皮から3D構造をもった接餌フィルター（ハウス）が折り畳まれた状態で分泌されるしくみ、の2つの3D形成に取り組む。

(1)については蛍光ライブイメージングにより個々の細胞の振る舞いをとらえるため、多面的かつ多くの4次元タイムラプスデータを取得する。

(2)については表皮シートの各領域から3Dのハウスがどのように分泌されるのか、セルロースや領域特異的な分泌タンパク質 (Oikosin)のイメージング、さらに細胞破壊実験により調べる。これらの実験データをもとに、シミュレーション・数理モデル構築による論理の抽出やその検証へと進めることを目指す。